SARS-CoV-2 diagnostika

SARS koroonaviirus 2 Ag (ribaanalüüs) (XXX-SARS-CoV-2 Ag strip) (antigeeni ribatest)

SARS koroonaviirus 2 RNA (Nose-SARS CoV-2 RNA) (qPCR)

Põhja-Eesti Regionaalhaigla laboratooriumi molekulaardiagnostika labor

Telefon: 617 1768, 617 1769

 

SARS-CoV-2 (COVID19) viiruse nukleokapsiidi vastased antikehad plasmas (P-SARS-CoV-2 (N) Ab)

Põhja-Eesti Regionaalhaigla laboratooriumi automaatliini labor

Telefon: 617 1027

 

Üldiseloomustus

31. detsembril 2019 teatati esmakordselt Maailma Terviseorganisatsioonile (WHO) teadmata päritoluga hingamisteede haiguspuhangust Wuhanis, Hiina Hubei provintsis. Uus koroonaviirus (2019-nCoV) põhjustas tuhandeid nakatumisi ja levis kiiresti üle maailma, põhjustades koroonaviiruse haiguse 2019 (COVID-19) pandeemia. Rahvusvaheline Viiruste Taksonoomiakomitee (ICTV) nimetas viiruse ümber SARS-CoV-2-ks. COVID-19 on seotud mitmesuguste kliiniliste tulemustega, sealhulgas asümptomaatilise nakatumise, kerge ülemiste hingamisteede infektsiooni, raske alumiste hingamisteede haiguse, näiteks kopsupõletiku ja hingamispuudulikkuse, ning mõnel juhul ka surmaga.

 

Näidustused

  • SARS-CoV-2 viirusinfektsiooni diagnoosimine (Nose-SARS CoV-2 RNA)
  • SARS-CoV-2 ägeda viirusinfektsiooni kiirdiagnoosimine (XXX-SARS-CoV-2 Ag strip)
  • SARS-CoV-2 läbipõdemise diagnoosimine (P-SARS-CoV-2 (N) Ab)

 

Referentsvahemik

Negatiivne (Nose-SARS CoV-2 RNA)

Negatiivne (XXX-SARS-CoV-2 Ag strip)

Negatiivne (P-SARS-CoV-2 (N) Ab)

 

Kliiniline tõlgendus

SARS-CoV-2 RNA qPCR

Positiivne RNA tulemus viitab SARS-CoV-2 viiruse infektsioonile. Positiivsele vastusele lisatakse labori poolt ka PCR analüüsi tsüklilävendi (Ct) väärtus, mis annab hinnangu, kas viirusosakeste hulk proovimaterjalis on suur või väike.

  1. Positiivne tulemus, Ct < 30;  tugev positiivne tulemus.

Viiruse hulk proovimaterjalis on suur, tegemist on ägedas faasis SARS-CoV-2 viiruse infektsiooniga.

  1. Positiivne tulemus, Ct 30-38; nõrk positiivne tulemus.

Viitab kas läbipõetud infektsioonile või varajasele nakatumise faasile. Tulemust tuleks hinnata sümptomite tekkeaja kontekstis. Antikehade olemasolu aitab viidata läbipõetud infektsioonile. Soovitatav on korrata PCR analüüsi 24-48h pärast. CT väärtuse vähenemine viitab hiljutisele nakatumisele.

  1. Positiivne tulemus, Ct > 38; piiripealne positiivne tulemus.

Viitab kas läbipõetud infektsioonile või varajasele nakatumise faasile. Tulemust tuleks hinnata sümptomite tekkeaja kontekstis. Antikehade olemasolu aitab viidata läbipõetud infektsioonile. Soovitatav on korrata PCR analüüsi 24-48 h pärast. CT väärtuse vähenemine viitab hiljutisele nakatumisele.

 

SARS-CoV-2 antigeeni ribatest

Positiivne antigeeni tulemus viitab ägedas faasis SARS-CoV-2 viiruse infektsioonile. Tulemus on võrdeline tugevalt positiivse RNA tulemusega. Positiivne proov kinnitatakse SARS-CoV-2 RNA PCR uuringuga.

Negatiivne antigeeni tulemus viitab ägedas faasis SARS-CoV-2 viiruse infektsiooni puudumisele. Tulemus ei välista kokkupuudet SARS-CoV-2 viirusega, varajast nakatumist või nõrka positiivset RNA tulemust.

 

SARS-CoV-2 viiruse nukleokapsiidi vastased antikehad

Positiivne tulemus viitab SARS-CoV-2 viiruse läbipõetud infektsioonile. Nukleokapsiidi vastased antikehad ilmuvad veres keskmiselt 14 päeva pärast positiivset SARS-CoV-2 RNA PCR tulemust. Negatiivne tulemus, koos nõrga positiivse SARS-CoV-2 RNA PCR tulemusega, viitab algavale SARS-CoV-2 infektsioonile ja kõrgele nakkusohtlikkusele.

 

Proovimaterjal

ninaneelukaabe (qPCR ja antigeeni ribatest)

veeniveri/plasma (P-SARS-CoV-2 (N) Ab)

Proovianum

UTM-katsuti koos proovivõtutampooniga (qPCR ja antigeeni ribatest)

Geeliga LH-katsuti (heleroheline kork) (P-SARS-CoV-2 (N) Ab)

Proovimaterjali säilivusaeg, -temperatuur jt transpordi tingimused

qPCR:             2...8 oC 72 h;

Antigeen:        15…25 oC  8h;

                        2...8 oC 12h;

Antikehad:      15…25 oC 7 päeva;

                        2...8 oC 14 päeva;

                        -20 oC 28 päeva;

Segavad tegurid

väga viskoosne proovimaterjal (qPCR ja antigeeni ribatest)

Teostamise sagedus

E-P 8-16 (qPCR ja antigeen)

24/7 (P-SARS-CoV-2 (N) Ab)

Mõõtemeetod

immuunkromatograafia (antigeeni ribatest)

qPCR (reaalaja polümeraasi ahelreaktsioon) (RNA uuring)

elektrokemiluminestsents immuunmeetod (ECLIA) – P-SARS-CoV-2 (N) Ab

HK kood

66710 (antigeeni ribatest), 66645 (qPCR), 66709 (P-SARS-CoV-2 (N) Ab)

 

Kasutatud kirjandus

1. Reaktiivi kasutusjuhend – Xpert Xpress SARS-CoV-2 kasutusjuhend 302-3562 Rev. C, 12/2022

2. Reaktiivi kasutusjuhend – SARS-CoV-2 Rapid Antigen Test originaaljuhend, versioon 4, 12/2021

3. Reaktiivi infoleht - Elecsys Anti-SARS-CoV-2, Roche Diagnostics, versioon 5, 07/2021

 

Koostanud Kedy Medar, Karl Mitt, Siim Iskül, Natalja Gumenjuk laborispetsialistid; Karel Tomberg, laboriarst; Kadi Rõuk, Mirjam Nuter, bioanalüütikud.

Muudetud 06.02.2024

Laboriuuringute valdkond