Pohjois-Viron Lääketieteellisen Keskuksen leikkausyksikössä suoritetaan vuosittain yli 22 000 leikkausta, joista noin 30 prosenttia on päivystystapauksia. Sairaalan uudessa X-rakennuksessa toimivaan leikkausyksikköön on keskitetty koko sairaalan kirurginen toiminta.
Nykyaikaisessa leikkausyksikössä on 18 leikkaussalia, joista kaksi on tarkoitettu päivystyspotilaiden hoitoon, sekä heräämö.
Suunniteltuja ja päivystyksen puitteissa tehtäviä leikkauksia tehdään useilla eri aloilla: ortopedia, urologia, gynekologia, yleiskirurgia, syöpäkirurgia, neurokirurgia, urologia, gynekologia, yleinen kirurgia, syöpäkirurgia, korva-, nenä- ja kurkkutaudit, sydän- ja verisuonikirurgia, rintaelinkirurgia, plastiikkakirurgia ja rekonstruoiva kirurgia, suun-, kasvojen- ja leuanalueen kirurgia, pään ja kaulan alueen kirurgia.
Leikkaussalit on jaettu leikkauksen keston mukaan neljään ryhmään:
1. ryhmä – päivystyksen puitteissa suoritettava leikkaukset
2. ryhmä – vatsaontelon sekä pään ja kaulanalueen kirurgia;
3. ryhmä – ortopedia ja neurokirurgia;
4. ryhmä – sydänkirurgia, verisuonikirurgia, rintaelinkirurgia;
Leikkaussalit ovat samankokoisia (49–52 m2) ja varustettu vastaavan erikoisalan laitteilla. Seitsemän leikkaussalia on varattu endoskoppiseen leikkauskäyttöön.
Kaikissa leikkaussaleissa on uudet, käyttöajaltaan pidemmät ja luonnollisemman valaistuksen takaavat ledileikkaussalivalaisimet ja leikkaussaleissa on myös pyörteetön ilmastointijärjestelmä, jonka avulla leikkauspöydän ympärille muodostetaan ns. puhdas ilmaverho, jonka avulla leikkaussalin ilma suodatetaan. Leikkausyksikössä on käytetty metallisia väliseiniä, joiden ruostumattomasta teräksestä valmistetut seinälevyt on varustettu äänieristyksellä ja ne myös suojaavat säteilyltä. Rakenteet voidaan koota ja purkaa helposti, joten leikkaussaleihin voidaan lisätä tarvittaessa uusia laitteita nopeasti tai siirtää laitteita salista toiseen. Leikkaussalien seinä- ja lattiamateriaalit ovat korkeimpien sairaalahygieniaa koskevien vaatimusten mukaisia.
Telelääketiede on aloittanut uuden vaiheen kirurgiassa ja leikkaussalissa 5 on vastaavat laitteet telelääketieteen hyödyntämiseen (kokonaan digitalisoitu leikkaussalin varustus). Laitteita voi käyttää hipaisunäytön avulla ja leikkaussalin tapahtumia voi seurata ja olla yhteydessä leikkaussaliin internetin välityksellä sairaalan konferenssisalista sekä myös muualta käsin.
Yksikön käytössä on koko kerros eli 2257 m².
Leikkausyksikkö toimii sekä Tarton yliopiston että Tallinnan terveydenhuollon ammattikorkeakoulun opiskelijoiden harjoittelupaikkana.
